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土壤宏病毒组的研究方法与进展
祁慧鹓; 郑晓璇; 孙明明; 王金锋; 马迎飞; 朱冬; 王风贺; 蒋新; 叶茂
2020-11-16
Source Publication土壤学报
Volume58Issue:03Pages:568-577
Abstract土壤是病毒遗传多样性的储存库,但由于土壤自身特性及技术手段的限制,基于传统培养方法对土壤病毒的研究及功能认知存在局限性。宏病毒组学技术能直接从土壤环境样品中获取病毒基因组,随后通过高通量测序、拼接组装、ORF预测,最终可对病毒基因进行功能注释,极大地丰富了对土壤病毒功能的认识。本文在阐释土壤病毒DNA提取、测序与病毒判别、功能基因注释等研究方法的基础上,重点探讨了单株噬菌体基因组,及近年来国内外土壤与极端陆地环境中宏病毒组研究进展。并对土壤宏病毒基因组研究的前沿和发展趋势进行了总结,强调了土壤病毒研究的整体化、技术流程规范化以及病毒资源库完善化的重要性。
Department土壤环境科学实验室
Keyword土壤病毒 噬菌体 宏病毒组 功能基因 注释
Document Type期刊论文
Identifierhttps://ir.rcees.ac.cn/handle/311016/46628
Collection土壤环境科学实验室
Affiliation1.中国科学院南京土壤研究所土壤环境与污染修复重点实验室
2.中国科学院大学
3.南京农业大学资源与环境科学学院土壤生态学实验室
4.中国科学院北京生命科学研究院
5.中国科学院深圳先进技术研究院
6.中国科学院生态环境研究中心
7.南京师范大学环境学院
Recommended Citation
GB/T 7714
祁慧鹓,郑晓璇,孙明明,等. 土壤宏病毒组的研究方法与进展[J]. 土壤学报,2020,58(03):568-577.
APA 祁慧鹓.,郑晓璇.,孙明明.,王金锋.,马迎飞.,...&叶茂.(2020).土壤宏病毒组的研究方法与进展.土壤学报,58(03),568-577.
MLA 祁慧鹓,et al."土壤宏病毒组的研究方法与进展".土壤学报 58.03(2020):568-577.
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